Diversidad genética del gen BoLA-DRB3 en el ganado criollo colombiano Hartón del Valle

Darwin Yovanny Hernández Herrera, Jaime Eduardo Muñoz Flórez, Luz Ángela Álvarez Franco

Resumen


El objetivo de esta investigación fue evaluar la diversidad genética del gen BoLA-DRB3 en el ganado criolloColombiano Hartón del Valle. En 93 animales Hartón del Valle (HV), 30 Lucerna (LUC) y 30 Holstein (HOL) seevaluó el polimorfismo del gen DRB3 usando la metodología PCR-SBT. Se encontraron 27 alelos en la raza HV,17 en LUC y 14 en HOL. El alelo más frecuente en HV fue el DRB3*1101 (14,5%), en la raza LUC los alelosDRB3*0701, *1107, *1501 y *2301 al igual que el alelo DRB3*0701 en la raza HOL tuvieron la frecuencia másalta (11,7%). Los valores de heterocigocidad esperada fueron más altos que la observada, lo que se tradujo en unvalor bajo del índice de fijación, valores de FIS positivos solo significativo en el HV y desviaciones del equilibriode Hardy-Weinberg no significativos en LUC. El análisis de varianza molecular reflejó poca variación entre razas(3%) y una diferenciación genética moderada (FST= 0,056 p<0,01). A nivel de secuencia se resalta que, la raza másdiversa es LUC, que no se está presentando selección neutral y que ninguna de las razas se encuentra en equilibriode selección balanceadora. La comparación con otras razas reportadas, mostró alta diversidad genética en las razascolombianas. Se concluye que la raza HV tiene alta diversidad genética en el locus BoLA-DRB3, que el origen delpolimorfismo puede deberse en parte al origen de la raza y que esta alta variación puede ser mantenida medianteequilibrio de selección.

Genetic diversity of BoLA-DRB3 gene in Colombian creole Hartón delValle cattle

The objective of this study was to evaluate the genetic diversity of ball-DRB3 gene in the Colombian creole Hartóndel Valle cattle. A total of 93 Hartón del Valle (HV), 30 Lucerne (LUC), and 30 Holstein (HOL) animals wereevaluated for DRB3 gene polymorphism using the PCR-SBT method. The number of alleles found were 27, 17 and14 for HV, LUC, HOL, respectively. The most frequent alleles were DRB3*1101 (14.5%) in HV; LUC DRB3 * 0701in LUC; and *1107, *1501 and *2301 in HOL (11.7%). Expected heterozygosity values were higher than observed,which resulted in a low fixing index, positive FIS (significant only for HV), and no significant deviations from Hardy-Weinberg equilibrium for LUC. The molecular analysis of variance reflected little variation between breeds (3%)and a moderate genetic differentiation (FST = 0.056 p<0.01). Regarding sequence, LUC was the most diverse breed,no neutral selection is occurring, and none of the breeds is in selection equilibrium. Comparison with reports onother breeds showed high genetic diversity in Colombian breeds. We conclude that HV has high genetic diversity inBoLA-DRB3 locus. The cause of this polymorphism may be due in part to the origin of HV. This high variation canbe maintained by selection equilibrium.

Diversidade genética do gene BoLA-DRB3 em gado crioulo colombianoHartón del Valle

O objetivo desta pesquisa foi avaliar a diversidade genética do gene BoLA-DRB3 no gado crioulo colombianoHartón del Valle. O estudo se fez com 93 animais Hartón del Valle (HV), 30 Lucerna (LUC) e 30 Holandês (HOL).Avaliou-se o polimorfismo do gene DRB3 utilizando a metodologia PCR-SBT. Encontraram-se 27 alelos na raçaHV, 17 em LUC e 14 em HOL. O alelo com maior frequência em HV foi o DRB3*1101 (14,5%), na raça LUC osalelos DRB3*0701, *1107, *1501 e *2301 ao igual que o alelo DRB3*0701 na raça HOL tiveram a maior frequência(11,7%). Os valores de heterocigocidade esperada foram maiores que a observada, o que se traduz em um valorbaixo do índice de fixação, valores de FIS positivos só foram significativos no HV e desvio do equilíbrio de Hardy-Weinberg foram não significativos em LUC. O Analice de variância molecular reflexou pouca variação entre raças(3%) e uma diferenciação genética moderada (FST= 0,056 p<0,01). No nível de sequência destacasse que, a raça maisdiversa é LUC, que não está apresentando seleção neutral e que nenhuma das raças encontra-se em equilíbrio deseleção balanceadora. Se comparar com outras raças reportadas, as raças colombianas exibiram uma alta diversidadegenética. Conclui-se que a raça HV tem alta diversidade genética no locus BoLA DRB3, que a origem do polimorfismopode se dever em parte à origem da raça e que essa alta variação pode ser mantida mediante o equilíbrio de seleção.


Palabras clave


Complejo mayor de histocompatibilidad, marcador genético, PCR-SBT.

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